花小金井駅南口ターミナルの供用開始に伴い，平成１２年４月１日に，同駅発着系統の手直しが行われた。境１１系統（武蔵境駅〜小平合同庁舎前間）と境１４系統（武蔵境駅〜多摩六都科学館前間：休日のみ運行）が廃止され，境１４の系統分断という形で境１６系統（武蔵境駅〜花小金井駅南口間）と花１０系統（花小金井駅南口〜多摩六都科学館前間：毎日運行）が新設された。境１１の廃止により，３月３１日を最後に，小平合同庁舎前の折返場は使用が停止された。

　境１６は日中毎時１本と，境１１時代の輸送量を引き継いでいる。一方で出入庫を除き日祭のみ運行されていた小平合同庁舎前以北では，約３０分間隔で毎日運行されるようになり，大幅に増便されている。

　今回の改正で，花小金井バス停が，南口ターミナルへの導入路上に移設されている。

★境１１―３４５６
武蔵境駅　1997.12.26

★境１４―３０１０
武蔵境駅　1998.1.4

★花１０―Ｂ３２６４
花小金井駅　2000.4.19