| 船名 | 番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 配属地 |
| やえざくら | CL-110 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第六管区 | 境 |
| やえぐも | PC-108 | はやぐも型 | 巡視艇 | 第七管区 | 対馬 |
| やえづき | PC-219 | むらくも型 | 巡視艇 | 第十管区 | 宮古島 |
| やぐるま | CL-120 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第一管区 | 小樽 |
| やしま | PLH-22 | みずほ型 | 巡視船 | 第三管区 | 横浜 |
| やなかぜ | CL-111 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第八管区 | 浜田 |
| やひこ | PL-04 | えりも型 | 巡視船 | 第九管区 | 新潟 |
| やまぎく | CL-259 | やまゆり型 | 巡視艇 | 第七管区 | 宇部 |
| やまぎり | PC-209 | むらくも型 | 巡視艇 | 第三管区 | 下田 |
| やまくに | PM-29 | とから型 | 巡視船 | 第七管区 | 大分 |
| やまざくら | CL-105 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第七管区 | 若松 |
| やまぶき | CL-136 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第三管区 | 東京 |
| やまゆり | CL-129 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第三管区 | 横浜 |
| 船名 | 番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 配属地 |
| ゆうぎり | PC-87 | なつぎり型 | 巡視艇 | 第三管区 | 横須賀 |
| ゆうづき | PC-80 | あきづき型 | 巡視艇 | 第三管区 | 横須賀 |
| ゆうな | CL-155 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第十一管区 | 中城 |
| ゆうばり | PM-11 | なつい型 | 巡視船 | 第一管区 | 網走 |
| ゆきかぜ | CL-81 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第一管区 | 花咲 |
| ゆきぐも | PC-203 | むらくも型 | 巡視艇 | 第一管区 | 函館 |
| ゆきつばき | CL-112 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第九管区 | 新潟 |
| ゆみかぜ | CL-90 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第七管区 | 伊万里 |
| ゆめかぜ | CL-34 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第三管区 | 東京 |
| ゆらかぜ | CL-74 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第八管区 | 舞鶴 |
| ゆりかぜ | CL-19 | ひめぎく型 | 巡視艇 | 第三管区 | 東京 |
| 船名 | 番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 配属地 |
| よしの | PM-27 | とから型 | 巡視船 | 第五管区 | 徳島 |
| よど | PC-51 | よど型 | 巡視艇 | 第三管区 | 鹿島 |
| よどぎく | CL-08 | はやぎく型 | 巡視艇 | 第五管区 | 大阪 |
| よなくに | PL-63 | はてるま型 | 巡視船 | 第十一管区 | 石垣 |