| 艦番号 | 艦名 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| MSO-301 | やえやま | やえやま型 | 掃海艦 | 第５１掃海隊 | 横須賀 |
| PC-301 | かり | かり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| MSO-302 | つしま | やえやま型 | 掃海艦 | 第５１掃海隊 | 横須賀 |
| PC-302 | きじ | かり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| MSO-303 | はちじょう | やえやま型 | 掃海艦 | 第５１掃海隊 | 横須賀 |
| PC-303 | たか | かり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-304 | わし | かり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-305 | かもめ | かもめ型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-306 | つばめ | かもめ型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-307 | みさご | かもめ型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-308 | はやぶさ | − | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-309 | うみたか | うみたか型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-310 | おおたか | うみたか型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-311 | みずどり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-312 | やまどり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-313 | おおとり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-314 | かささぎ | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-315 | はつかり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-316 | うみどり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-317 | わかたか | うみたか型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-318 | くまたか | うみたか型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-319 | しらとり | みずどり型 | 駆潜艇 | 除籍 | − |
| PC-320 | ひよどり | みずどり型 | 駆潜艇 |
特務艇に種別変更 のち、除籍 | − |
| 艦番号 | 艦名 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| ASR-401 | ちはや | − | 潜水艦救難艦 | 除籍 | − |
| ASR-402 | ふしみ | − | 潜水艦救難艦 | 除籍 | − |
| ASR-403 | ちはや | − | 潜水艦救難艦 | 第１潜水隊群直轄艦 | 呉 |
| AS-405 | ちよだ | − | 潜水艦救難母艦 | 第２潜水隊群直轄艦 | 横須賀 |
| (AO)AOE-411 | はまな | − | 補給艦 | 除籍 | − |
| AOE-421 | さがみ | − | 補給艦 | 除籍 | − |
| AOE-422 | とわだ | とわだ型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 呉 |
| AOE-423 | ときわ | とわだ型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 横須賀 |
| AOE-424 | はまな | とわだ型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 佐世保 |
| AOE-425 | ましゅう | ましゅう型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 舞鶴 |
| AOE-426 | おうみ | ましゅう型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 佐世保 |
| MST-461 | はやとも | − | 掃海母艦 | 除籍 | − |
| MST-462 | はやせ | − | 掃海母艦 |
特務艦に種別変更 のち、除籍 | − |
| MST-463 | うらが | うらが型 | 掃海母艦 | 掃海隊群直轄艦 | 横須賀 |
| MST-464 | ぶんご | うらが型 | 掃海母艦 | 掃海隊群直轄艦 | 呉 |
| MST-471 | なさみ | なさみ型 | 掃海母艇 | 除籍 | − |
| MST-472 | みほ | なさみ型 | 掃海母艇 | 除籍 | − |
| MST-473 | こうづ | かさど型 | 掃海母艇 | 除籍 | − |
| MST-474 | おおつ | かさど型 | 掃海母艇 | 除籍 | − |
| MST-475 | うとね | たかみ型 | 掃海母艇 | 除籍 | − |
| MST-476 | ふくえ | たかみ型 | 掃海母艇 |
掃海管制艇に種別変更 のち、除籍 | − |
| ARC-481 | つがる | − | 敷設艦 | 除籍 | − |
| ARC-482 | むろと | − | 敷設艦 | 海洋業務群 | 呉 |
| AMC-491 | えりも | − | 敷設艇 | 除籍 | − |
| 艦番号 | 艦名 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| LSSL-401(1) | ゆり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-402(2) | きく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-403(3) | はぎ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-404(4) | らん | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-405(5) | ふじ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-406(6) | ばら | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-407(7) | すみれ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-408(8) | あおい | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-409(9) | けし | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-410(10) | あやめ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-411(11) | あかね | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-412(12) | ふよう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-413(13) | のぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-414(14) | やまぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-415(15) | はまぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-416(16) | いそぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-417(17) | しらぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-418(18) | いわぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-419(19) | あざみ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-420(20) | かいどう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-421(21) | りんどう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-422(22) | つつじ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-423(23) | ひまわり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-424(24) | ひいらぎ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-425(25) | あじさい | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-426(26) | えぞぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-427(27) | ひなぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-428(28) | さわぎく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-429(29) | つた | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-430(30) | はす | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-431(31) | しだ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-432(32) | すいれん | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-433(33) | やまぶき | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-434(34) | れんげ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-435(35) | せきちく | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-436(36) | おにゆり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-437(37) | やまゆり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-438(38) | すずらん | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-439(39) | はまゆう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-440(40) | しょうぶ | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-441(41) | かんな | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-442(42) | ぼたん | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-443(43) | ひめゆり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-444(44) | ささゆり | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-445(45) | すすき | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-446(46) | かるかや | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-447(47) | ききょう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-448(48) | けいとう | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-449(49) | すいせん | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| LSSL-450(50) | やぐるま | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |