| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| はぎ | LSSL-403(3) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| はしだて | ASY-91 | − | 特務艇 | 横須賀警備隊 | 横須賀 |
| はしま | MSC-652 | やしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| はしら | MSC-647 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| はす | LSSL-430(30) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| はたかぜ（T） | DD-182 | あさかぜ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| はたかぜ | DDG-171 | はたかぜ型 | 護衛艦 | 第４護衛隊 | 横須賀 |
| はちじょう | MSO-303 | やえやま型 | 掃海艦 | 第５１掃海隊 | 横須賀 |
| はつかり |
(PC-315) ASU-62 | みずどり型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| はつしま |
(MSC-649) YAS-98 | はつしま型 |
(掃海艇) 特務船 | 除籍 | − |
| はつひ | DE-263 | はつひ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| はつゆき | DD-122 | はつゆき型 | 護衛艦 | 第１１護衛隊 | 横須賀 |
| ははじま |
MCL-724 (MSC-660) | はつしま型 |
掃海管制艇 (掃海艇) | 除籍 | − |
| はぶし | MSC-608 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| はまぎく | LSSL-415(15) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| はまぎり | DD-155 | あさぎり型 | 護衛艦 | 第４護衛隊 | 大湊 |
| はましお |
(SS-578) TSS-3604 | ゆうしお型 |
(潜水艦) 練習潜水艦 | 除籍 | − |
| はまな（T） | (AO)AOE-411 | − | 補給艦 | 除籍 | − |
| はまな | AOE-424 | とわだ型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 佐世保 |
| はまゆう | LSSL-439(39) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| はまゆき | DD-126 | はつゆき型 | 護衛艦 | 第１４護衛隊 | 舞鶴 |
| はやしお（T） | SS-521 | はやしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| はやしお |
(SS-585) TSS-3606 | はるしお型 |
（潜水艦） 練習潜水艦 | 第１練習潜水隊 | 呉 |
| はやせ |
(MST-462) ASU-7020 | − |
（掃海母艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| はやとも | MST-461 | − | 掃海母艦 | 除籍 | − |
| はやぶさ（T） |
(PC-308) ASY-91 | − |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| はやぶさ | PG-824 | はやぶさ型 | ミサイル艇 | 第２ミサイル艇隊 | 舞鶴 |
| ばら | LSSL-406(6) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| はりお | MSC-618 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| はりま | AOS-5202 | ひびき型 | 音響測定艦 | 海洋業務群 | 呉 |
| はるかぜ |
(DD-101) ASU-7002 | はるかぜ型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| はるさめ（T） |
(DD-109) ASU-7008 | むらさめ型（T） |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| はるさめ | DD-102 | むらさめ型 | 護衛艦 | 第６護衛隊 | 横須賀 |
| はるしお（T） | SS-563 | あさしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| はるしお | SS-583 | はるしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| はるな | DDH-141 | はるな型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| はるゆき | DD-128 | はつゆき型 | 護衛艦 | 第１３護衛隊 | 佐世保 |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| ひいらぎ | LSSL-424(24) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ひうち | AMS-4301 | ひうち型 | 多用途支援艦 | 舞鶴地方隊直轄艦 | 舞鶴 |
| ひえい | DDH-142 | はるな型 | 護衛艦 | 第４護衛隊 | 呉 |
| ひびき | AOS-5201 | ひびき型 | 音響測定艦 | 海洋業務群 | 呉 |
| ひこしま | MSC-669 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| ひなぎく | LSSL-427(27) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ひまわり | LSSL-423(23) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ひめしま | MSC-665 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| ひめゆり | LSSL-443(43) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ひゅうが | DDH-181 | ひゅうが型 | 護衛艦 | 第１護衛隊 | 横須賀 |
| ひよどり |
(ASY-320) ASY-92 | みずどり型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| ひらしま(I) | MSC-614 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| ひらしま | MSC-601 | ひらしま型 | 掃海艇 | 第２掃海隊 | 佐世保 |
| ひらど | MSC-614 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| ふくえ | MSC-645 | たかみ型 | 掃海管制艇 | 除籍 | − |
| ふじ | LSSL-405(5) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ふじ | AGB-5001 | − | 砕氷艦 | 除籍 | − |
| ふしみ | ASR-402 | − | 潜水艦救難艦 | 除籍 | − |
| ふたみ | AGS-5102 | ふたみ型 | 海洋観測艦 | 海洋業務群 | 横須賀 |
| ぶな | PF-294 | かし型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| ふゆしお | SS-588 | はるしお型 | 潜水艦 | 第３潜水隊 | 呉 |
| ふよう | LSSL-412(12) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| ぶんご | MST-464 | うらが型 | 掃海母艦 | 掃海隊群直轄艦 | 呉 |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| ほたか | MSC-616 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| ぼたん | LSSL-442(42) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |