| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| あいしま | MSC-688 | すがしま型 | 掃海艇 | 第１掃海隊 | 呉 |
| あおしま | MSC-689 | すがしま型 | 掃海艇 | 第46掃海隊 | 勝連 |
| あおい | LSSL-408(8) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| あおくも |
(DD-119) TV-3512 | やまぐも型 |
(護衛艦) 練習艦 | 除籍 | − |
| あかね | LSSL-411(11) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| あきぐも |
TV-3514 (DD-120) | やまぐも型 |
（護衛艦） 練習艦 | 除籍 | − |
| あきしお | SS-579 | ゆうしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| あきづき |
(DD-161) ASU-7010 | あきづき型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| あけぼの（T） | DE-201 | - | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あけぼの | DD-108 | むらさめ型 | 護衛艦 | 第１護衛隊 | 呉 |
| あさかぜ（T） | DD-181 | あさかぜ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あさかぜ | DDG-169 | たちかぜ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あさぎり |
(DD-151) TV-3516 | あさぎり型 |
（護衛艦） 練習艦 | 第１練習隊 | 呉 |
| あさぐも |
(DD-115) ASU-7018 | やまぐも型 |
(護衛艦) 特務艦 | 除籍 | − |
| あさしお（T） | SS-562 | あさしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| あさしお |
(SS-589) TSS-3601 | はるしお型 |
（潜水艦） 練習潜水艦 | 第１練習潜水隊 | 呉 |
| あさひ | DE-262 | はつひ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あざみ | LSSL-419(19) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| あさゆき | DD-132 | はつゆき型 | 護衛艦 | 第１３護衛隊 | 佐世保 |
| あじさい | LSSL-425(25) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| あしがら | DDG-178 | あたご型 | 護衛艦 | 第２護衛隊 | 佐世保 |
| あすか | ASE-6102 | − | 試験艦 | 開発隊群 | 横須賀 |
| あたご | DDG-177 | あたご型 | 護衛艦 | 第３護衛隊 | 舞鶴 |
| あただ | MSC-601 | あただ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| あづま | ATS-4102 | − | 訓練支援艦 | 除籍 | − |
| あつみ | LST-4101 | あつみ型 | 輸送艦 | 除籍 | − |
| あぶくま | DE-229 | あぶくま型 | 護衛艦 | 第１４護衛隊 | 舞鶴 |
| あまぎり | DD-154 | あさぎり型 | 護衛艦 | 第２護衛隊 | 舞鶴 |
| あまくさ | AMS-4303 | ひうち型 | 多用途支援艦 | 佐世保地方隊直轄艦 | 佐世保 |
| あまつかぜ | DDG-63 | − | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あまみ | MSC-625 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| あらしお | SS-586 | はるしお型 | 潜水艦 | 第３潜水隊 | 呉 |
| あやせ | DE-216 | ちくご型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| あやなみ |
(DD-103) ASU-7004 | あやなみ型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| あやめ | LSSL-410(10) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| あらしお | SS-565 | あさしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| ありあけ（T） | DD-183 | ありあけ型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| ありあけ | DD-109 | むさらめ型 | 護衛艦 | 第７護衛隊 | 佐世保 |
| あわじ | MSC-634 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| あわしま | MSC-670 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| いえしま | MSC-673 | うわじま型 | 掃海艇 | 第４３掃海隊 | 下関 |
| いおう | MSC-630 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| いかづち（T） | DE-202 | いかづち型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| いかづち | DD-107 | むらさめ型 | 護衛艦 | 第５護衛隊 | 横須賀 |
| いしかり | DE-226 | − | 護衛艦 | 除籍 | − |
| いずしま | MSC-687 | すがしま型 | 掃海艇 | 第１掃海隊 | 呉 |
| いすず |
(DE-211) ASU-7015 | いすず型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| いそぎく | LSSL-416(16) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| いそしお（T） | SS-568 | うずしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| いそしお | SS-594 | おやしお型 | 潜水艦 | 第一潜水隊 | 呉 |
| いそなみ |
DD-104) TV-3502 | あやなみ型 |
（護衛艦） 練習艦 | 除籍 | − |
| いそゆき | DD-127 | はつゆき型 | 護衛艦 | 第１３護衛隊 | 呉 |
| いつき | MSC-602 | あただ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| いなづま（T） | DE-203 | いかづち型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| いなづま | DD-105 | むらさめ型 | 護衛艦 | 第８護衛隊 | 呉 |
| いぶき | MSC-628 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| いわい | MSC-648 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| いわぎく | LSSL-418(18) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| いわせ | DE-219 | ちくご型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| うきしま（T） | MSC-653 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| うくしま | MSC-686 | すがしま型 | 掃海艇 | 第２掃海隊 | 佐世保 |
| うじしま | MSC-655 | うじしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| うずしお（T） | SS-566 | うずしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| うずしお | SS-592 | おやしお型 | 潜水艦 | 第２潜水隊 | 横須賀 |
| うとね | MSC-633 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| うみぎり | DD-158 | あさぎり型 | 護衛艦 | 第４護衛隊 | 呉 |
| うみたか（Ｉ） |
(PC-309) ASU-86 | うみたか型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| うみたか | PG-828 | はやぶさ型 | ミサイル艇 | 第２ミサイル艇隊 | 舞鶴 |
| うみどり |
(PC-316) ASU-63 | みずどり型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| うめ | PF-289 | かし型 | 護衛艦 | 除籍 | − |
| うらが | MST-463 | うらが型 | 掃海母艦 | 掃海隊群直轄艦 | 横須賀 |
| うらなみ |
(DD-105) ASU-7005 | あやなみ型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| うるめ | MSC-626 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| うわじま | MSC-672 | うわじま型 | 掃海艇 | 第４５掃海隊 | 函館 |
| うんりゅう | SS-502 | そうりゅう型 | 潜水艦 | 艤装中 | − |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| エアクッション艇１号 | LCAC-01 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| エアクッション艇２号 | LCAC-02 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| エアクッション艇３号 | LCAC-03 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| エアクッション艇４号 | LCAC-04 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| エアクッション艇５号 | LCAC-05 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| エアクッション艇６号 | LCAC-06 | エアクッション艇１号型 | 輸送艇 | 第１エアクッション艇隊 | 呉 |
| えぞぎく | LSSL-426(26) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| えたじま（T） | MSC-656 | うじしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| えたじま | MSC-663 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| えのしま | MSC-652 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| えりも | AMC-491 | − | 敷設艇 | 除籍 | − |
| えんしゅう | AMS-4305 | ひうち型 | 多用途支援艦 | 横須賀地方隊直轄艦 | 横須賀 |
| 艦名 | 艦番号 | タイプ名 | 種別 | 所属 | 定係港 |
| おうみ （別） | MSC-644 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| おうみ | AOE-426 | ましゅう型 | 補給艦 | 第1海上補給隊 | 佐世保 |
| おおい |
(DE-214) ASU-7017 | いすず型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| おおしお | SS-561 | − | 潜水艦 | 除籍 | − |
| おおしま | MSC-654 | はつしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| おおすみ（T） | LST-4001 | おおすみ型（１） | 輸送艦 | 除籍 | − |
| おおすみ | LST-4001 | おおすみ型 | 輸送艦 | 第１輸送隊 | 呉 |
| おおたか（T） |
(PC-310) ASU-88 | うみたか型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| おおたか | PG-826 | はやぶさ型 | ミサイル艇 | 第３ミサイル艇隊 | 佐世保 |
| おおつ | MSC-621 | かさど型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| おおとり |
(PC-313) ASU-61 | みずどり型 |
（駆潜艇） 特務艇 | 除籍 | − |
| おおなみ（T） |
(DD-111) ASU-7013 | あやなみ型 |
（護衛艦） 特務艦 | 除籍 | − |
| おおなみ | DD-111 | たかなみ型 | 護衛艦 | 第６護衛隊 | 横須賀 |
| おおよど | DE-231 | あぶくま型 | 護衛艦 | 第１６護衛隊 | 佐世保 |
| おきしお |
(SS-576) TSS-3603 | ゆうしお型 | 潜水艦 | 除籍 | − |
| おぎしま（T） | MSC-659 | うじしま型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| おぎしま | MCL-726 | はつしま型 | 掃海管制艇 | 第１０１掃海隊 | 呉 |
| おきつ | MSC-646 | たかみ型 | 掃海艇 | 除籍 | − |
| おじか | LST-4152 | みうら型 | 輸送艦 | 除籍 | − |
| おにゆり | LSSL-436(36) | ゆり型 | 警備艇 | 除籍 | − |
| おやしお（T） | SS-511 | − | 潜水艦 | 除籍 | − |
| おやしお | SS-590 | おやしお型 | 潜水艦 | 第２潜水隊 | 横須賀 |